中国农科院特产所**破译鹿科动物全基因组序列

2018/3/22 来源：互联网标签：鹿科动物基因

近日，由中国**科学院特产研究所李光玉研究员带领创新团队在国际上**破译鹿科动物全基因组序列。驯鹿全基因组测序的完成，不仅为研究人员从基因组水平挖掘驯鹿生长、代谢和抗寒等重要性状的分子机制提供了科学指导，而且为驯鹿驯化历史、基因组演化、群体遗传及鹿类动物的进化等理论研究奠定了重要基础。相关研究成果于11月1日在线发表在《GigaScience》上。我国是鹿类动物资源**为丰富的**，分布约有20种鹿类动物，而驯鹿是**代表性的鹿科动物之一，是鹿科物种中**被驯化、雌雄个体均生长鹿角的鹿科动物。

鉴于该物种独特的生物学特征和重要的科研价值，特产所特种动物营养与饲养创新团队的研究人员，对一只雌性驯鹿进行了全基因组测序并获得了高质量的组装序列，基因组大小为2.64 Gb, Contig N50和Scaffold N50分别为89.7kb和0.94 Mb；基于同源比较和从头预测的方法，注释得到了21,555个蛋白编码基因、159个rRNA、863个tRNA、547个miRNA和1,339个snRNA。系统发育分析表明驯鹿与牛科物种的分化时间大约在2950万年，进一步的比较基因组学分析识别了335个驯鹿所特有的基因家族。

该项研究得到了中国农科院科技创新工程和**自然科学基金等项目的资助，研究成果在线预发表期间即受到了广泛关注，并且荣获第十二届国际基因组大会GigaScience前沿研究奖。据了解，该团队目前为国际上鹿类动物消化道微生物组研究成效**为突出的研究团队。近5年来，团队先后系统性地研究了梅花鹿消化道微生物组的定植与演替规律，阐明了宿主-日粮-瘤胃微生物组三者之间的互作响应机制，相关论文发表在《环境微生物学报告（Environmental Microbiology Report）》《微生物生态（Microbial Ecology）》《BMC微生物学（BMC Microbiology）》及《科学报告（Scientific Reports）》等国际期刊上，得到了国内外同行的广泛关注。